传染性支气管炎是由传染性支气管炎病毒引起的一类高度接触性疾病，给养禽业造成重大经济损失。该疾病主要侵害鸡的呼吸系统和泌尿生殖系统，造成肉鸡增重减少，蛋鸡产蛋数量和质量下降。传染性支气管炎病毒为RNA病毒，基因组约27kb大小。病毒粒子有三个主要的结构蛋白，其中的S蛋白在翻译后会被剪切成S1和S2两个亚基。S1亚基位于病毒粒子的表面，在病毒感染宿主细胞的过程中起重要作用；另外，在病毒感染机体后，S1亚基能诱导机体产生特异性的中和抗体，研究发现，决定血清型特异性的抗原表位主要在S1亚基的高变区。目前传染性支气管炎病毒存在的主要问题是其高突变性，各种新的血清型毒株不断出现，而确定它们的血清型对该区域免疫疫苗的选择至关重要，通过S1基因的序列尤其是S1基因高变区的序列进行基因分型是经常使用的IBV基因分型方法，通过测定S1基因的-位的碱基序列进行分型与测定S1基因全序列进行的分型结果基本是相符的，而且研究发现根据S1的高变区1与高变区2进行的分型与血清学的中和实验结果相符。在年的一月到六月半年的时间，泰国的东部有13个鸡场爆发了轻度的呼吸道疾病，表现为咳嗽、气喘、打喷嚏和气管啰音，而这些鸡场皆免疫过弱毒疫苗H，将发病鸡剖检发现有轻度的气管炎，没有化脓性的气囊炎，肾脏也没有肉眼可见的病变。将气管和肺部的病料混合研磨提取RNA，同时接种SPF鸡胚用以分离病毒。PCR鉴定为传染性支气管炎病病毒感染。扩增这13株的S1基因，对其进行测序，并与一些标准序列进行比对，构建进化树。系统进化树显示，13株传染性支气管炎病毒被分为明显不同的两组，分别命名为1组和2组。1组中5株毒株的核苷酸与氨基酸同源性在99%到%之间，但与Genbank上公布的一些标准序列的核苷酸和氨基酸的同源性分别少于85%和84%，即同源性较低，新的血清型、突变株的出现可能是由于大范围的使用疫苗造成了免疫压力造成的，混合感染导致基因重组也是其中重要的原因，此外疫苗免疫使得主要血清型的病毒感染能力下降也会导致其他血清型的野毒株爆发；2组的8株S1序列之间的核苷酸与氨基酸序列的同源性也在99%到%，与我国同期公布序列的同源性都高达96%以上，同源性很高。由此可以看出，目前泰国主要有两个类型的传染性支气管炎流行毒株，其中一个类型是泰国所特有的。
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