目前IBV没有明确的分型标准，可通过临床上的病变进行分型，也可通过血清型或基因型进行分型。
一、临床分型
根据病毒对组织的亲嗜性及损害的主要靶器官来确定，主要分为呼吸型、生殖型、肾型、腺胃型、肠型、肌肉型（变异型）。
但许多所谓的新型IB，其实并非都由特异型的病原直接引起。同一毒株IBV在不同诱因下，可能产生差别很大的临床表现，IB的临床表现型可能并不是毒株致病特性的真实反映。
01呼吸型传支
代表毒株为麻省毒株（又叫马萨诸塞型毒株，简称M株）H52、H和康涅狄格型Conn。国内常用疫苗为H、H52预防。
呼吸型传支的具体表现：伸颈张口呼吸、咳嗽、打喷嚏、呼吸啰音等症；2周内幼鸡还表现鼻窦肿胀、流鼻液、流泪、频频甩头；病情严重时，病鸡精神沉郁、食欲废绝、羽毛松乱、体温升高、怕冷扎堆、甚至引起死亡；康复鸡大多发育不良，形体消瘦；蛋雏鸡还会因输卵管损伤而严重影响或完全丧失产蛋能力。5-6周以上的鸡发病症状与幼鸡相似，但因器官内滞留大量分泌物而造成的异常呼吸音“咕噜”声更明显，尤其以夜间最清晰。另外较少见到流鼻液的现象。这种呼吸道症状可持续1-2周，同时有黄白色或绿色下痢，但死亡率较幼雏低。
剖检病变：剖检气管内有大量粘液，支气管栓塞，喉头有大量出血点等。同时也危及育成鸡和产蛋鸡群，造成输卵管萎缩和囊肿，使产蛋下降，蛋品质降低。表现为蛋品质下降，畸形蛋，同时产蛋率也下降，剖检可见输卵管和卵巢发生病变。
02生殖型传支
多由早期感染类4/91和M型IBV所致。代表毒株是麻省毒株（又叫马萨诸塞型毒株，简称M株）H52、H。
临床表现：病毒主要侵害后备母鸡的输卵管，临床上发病不明显，死亡率也很低。这些鸡到成年时从外观看类似健康鸡，鸡冠发红，有的腹部肿胀下垂，
剖检特征：卵巢发育正常，输卵管发生炎症，导致输卵管堵塞，炎症渗出物在输卵管中形成包囊，大如气球。在卵巢成熟的卵泡无法进入输卵管形成蛋，坠落到腹腔中，造成产蛋障碍综合症，即所谓的“假母鸡”。
近年来生殖道型在一些地区的种鸡中发病比较严重，平均发病率为15%～30%。目前对于引起这类临床表现的毒株与引起其它型临床表现的毒株有何差别尚未清楚，有待进一步研究。生殖道型IB是近年来在蛋鸡和种鸡中越来越明显的一个问题。
成年鸡感染传支后呼吸道症状较轻微，相比之下产蛋性能的变化更明显，表现为：开产推迟，产蛋量明显下降，降幅在25-50%之间，可持续4-8周。同时畸形蛋、软壳蛋、粗壳蛋增多。蛋的品质也下降，蛋清稀薄如水，蛋黄与蛋清分离。康复后，产蛋量很难恢复到发病前水平。
产蛋鸡病变：多表现为卵泡充血、出血、变形、破裂，甚至发生卵黄性腹膜炎。若雏鸡阶段（即两周龄之内，越早感染，“假母鸡”越严重）感染过IB，则成年后鸡的输卵管发育不全，长度不及正常的1/2，管腔狭小、闭塞，形成“假母鸡”。
03肾型传支
代表毒株是澳大利亚T株、美国Hotle和Gray以及一些M株。（(年发现的Holte/cumming及澳洲T株，被认为古典嗜肾型)。最早于年发现于澳大利亚的一株高致肾型毒株T株。我国于年开始多发。
临床表现：剖检表现为肾肿大，大量尿酸盐沉积，典型花斑肾。鸡群感染后，一般先出现呼吸道症状，继而出现肾脏病变。国内常用的疫苗为W93、28/86（均属于M株）。
肾型传支的具体表现：主要发生于2-4周的鸡，最初表现短期（1-4天）的轻微呼吸道症状，包括啰音、喷嚏、咳嗽等，但只有在夜间才较明显。如无混合感染导致的明显症状，常常容易被忽视。呼吸道症状消失后不久，鸡群会突然大量发病，出现厌食、口渴、精神不振、弓背扎堆等症状，同时排出水样白色稀粪，内含大量尿酸盐，肛门周围羽毛污浊。病鸡因脱水而体重减轻，胸肌发绀，重者鸡冠、面部及全身皮肤颜色发暗。发病10-12天达到死亡高峰，21天后死亡停止，死亡率为30%。产蛋鸡感染后也会引起产蛋率下降，产异常蛋和死胚率增加，但死亡不多。
肾型传支病变：主要表现为肾脏苍白、肿大、小叶突出。肾小管和输尿管扩张，沉积大量尿酸盐，使整个肾脏外观呈现斑驳状的白色网格线，俗称“花斑肾”。严重病例，尿酸盐还会沉积在其他脏器表面，出现所谓“痛风”。发生尿石症的鸡除输尿管扩张，内有砂粒状结石外，还往往出现一侧肾高度肿大，同时另一侧肾萎缩。
04腺胃型传支（QX型）
年发现于青岛，表现为羽毛发育不良，生长缓慢，剖检腺胃肿大，外观似球，腺胃粘膜出血。多发生于秋冬季，多继发于鸡痘，且蛋鸡发病率高于肉鸡。该病的发生与许多因素有关，回归试验尚未复制出本病，故尚无定论。
05肠型传支
年摩洛哥首次分离，以摩洛哥G株为代表，该毒株除引起气管、肾脏和生殖道病变外，对肠道有较强的亲和力，造成肠道损伤，造成肠道出血，肠道粘膜脱落，降低饲料利用率。我国尚未见此方面的报道。感染G株后，从回肠、盲肠、扁桃体及法氏囊分离出的时间要比食管和空肠都早。肠道后段的病毒滴度与气管和肾脏相比较高，可使前段（腺胃、十二指肠、空肠）中病毒滴度较低。感染G株后的鸡表现脱水、气管中有过多的粘血液，粘膜粘膜水肿。
06肌肉型传支（变异型）
年英国发现，以/B（也称作4/91）为代表，主要引起的深层肌肉病变，表现为深部肌肉苍白、肿胀，也可见胸肌表面出血并有一层胶冻样水肿，双侧性肌病侵害表层和深层胸肌。
该病可危害雏鸡和成鸡，除了可感染产蛋鸡外，也可感染肉鸡。传统疫苗（H、H52、MA5）免疫无效。临床表现为呼吸道症状、腹泻、死亡、产蛋下降、蛋壳变化，剖检见气管炎症、肾肿胀、胸肌苍白、甚至出血、水肿。相似病情及毒株已遍欧、亚、南美等世界各国。已有证据表明IBV类4/91毒株在我国北京地区、华南和西南地区流行。
二、血清分型
方法很多，没有标准的分型方法，主要应用的方法为鸡胚交叉中和试验，气管环试验，血凝抑制试验和单克隆抗体分型。如胡北侠年用血清交叉中和试验将19株IBV分为5个血清型。
?IBV血清型众多，不同血清型毒株之间的交叉免疫保护作用较差。
三、基因分型
方法有RT-PCR序列测定、RT-PCR结合限制性内切片段多肽分析(RFLP)技术，和核苷酸指纹图谱分析(ONF)等。一般基于S1基因的分型。
?S1基因的系统进化发育树能更客观地阐释各个分离株间的血清型或病毒主要抗原决定簇的关系。
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